MySQL incorpora una característica única llamada «motores de almacenamiento», que nos permite seleccionar el tipo de almacenamiento interno de cada tabla, en base al que mejor se adecue a una situación particular. Dicha selección, la hace el desarrollador a nivel de tabla, y no afecta a la manera en que el servidor interactúa con el cliente: los comandos SQL serán los mismos sea cual sea el motor de almacenamiento escogido. El cliente no necesita saber cómo se almacenan los datos. En este SGBDR (Sistema Gestor de Bases de Datos Relacionales) existen 9 motores de almacenamiento, además de los desarrollados por terceras partes, incorporables al servidor. Los motores MyISAM e InnoDB son los más empleados. También es sabido, que la mayoría no toma en cuenta el motor de almacenamiento al crear una tabla y acepta el que viene por defecto en la base de datos. Con el fin de tomar una decisión acerca de cuál motor escoger, primero tenemos que pensar en las diferentes funcionalidades básicas en cada uno de los motores que nos permitan diferenciarlos entre ellos.
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